Ernst Jokl wurde am 6. Oktober 1878 in Kremsier, dem heutigen Kroměříž, geboren, das damals zu Österreich-Ungarn gehörte. Er besuchte das deutsche Gymnasium in Brünn und studierte anschließend Musikwissenschaften an der Universität Wien, wo er 1905 mit der Promotion abschloss. Im folgenden Jahr begann er seine musikalische Karriere als Kapellmeister und Korrepetitor an der Wiener Volksoper, wechselte 1908 als Kapellmeister nach Plauen, ging 1909 ans Stadttheater Bremen und gelangte 1910 als Korrepetitor an die New Yorker Metropolitan Opera. 1911 kehrte er als Kapellmeister an die Wiener Volksoper zurück, bevor er in gleicher Funktion 1912 am Theater in Olmütz und 1913 am Stadttheater Bremerhaven wirkte. Während des Ersten Weltkriegs versah er seinen Dienst im Heer des mit dem Deutschen Reich verbündeten Österreich-Ungarn.
Im Jahr 1924 wurde Jokl als leitender Korrepetitor an die Krolloper engagiert und setzte seine Tätigkeit nach der Schließung des Hauses 1931 an der Staatsoper fort. Daneben unterrichtete er von 1925 bis 1932 Korrepetition an der Berliner Hochschule für Musik. Die Nazi-Betriebszelle setzte ihn, wie die anderen jüdischen Ensemblemitglieder, im Frühjahr 1933 auf ihre „Judenliste“. Obwohl als „Frontkämpfer“ des Ersten Weltkriegs eigentlich gegen eine außerordentliche Kündigung geschützt, wurde er am 1. Juni 1933 entlassen. Die Intendanz umging den Rechtsschutz, indem sie dem zuständigen preußischen Kultusminister vorschlug, den im August auslaufenden Vertrag mit Hinweis auf das „Gesetz zur Wiederherstellung des Berufsbeamtentums“ nicht mehr zu verlängern.
Jokl floh aus Europa und traf am 27. Oktober 1936 mit dem Dampfer Westernland von Antwerpen aus in New York ein. Er reiste zunächst weiter nach Kuba, kehrte aber am 5. September 1937 über Miami in die USA zurück. Dort ließ er sich erst in New York nieder, zog aber bald aber nach Los Angeles, wo er im Oktober 1943 die amerikanische Staatsbürgerschaft erlangte.
Wie der Musiker die folgenden Jahre verbrachte ist bislang ungeklärt. Am 20. Februar 1949 ist Ernst Jokl in Los Angeles gestorben.
1878 Kroměříž (Kremsier)
1949 Los Angeles